Năm 1997, thành phố Đà Nẵng trực thuộc Trung ương, trường được thành lập theo đơn vị hành chính mới theo quyết định số75/GD-ĐT của Sở GD-ĐT ngày 5/7/1997.
Trường được vinh dự mang tên anh Bế Văn Đàn, một thanh niên dân tộc Tày, đã dũng cảm "lấy thân mình làm giá súng" để đồng đội tiêu diệt địch ở trận đánh Mường Pồn. Anh được Nhà nước phong tặng danh hiệu "Anh hùng quân đội nhân dân"
Từ năm 1985 đến 1995 trường có 3 cơ sở, năm học 1996-1997 trường tập trung tại một điểm hiện nay. Nhờ điều kiện cơ sở vật chất ổn định nên chất lượng toàn diện phát triển tốt, trường đã lập được lập được nhiều thành tích thi đua mới.
Năm học 1997-1998, Bộ GD-ĐT cấp bằng công nhận trường tiểu học đạt chuẩn quốc gia giai đoạn 1996-2000 và cũng là trường tiểu học đạt chuẩn đầu tiên của thành phố Đà Nẵng. Năm 2010 trường được UBND thành phố Đà Nẵng cấp bằng công nhận trường đạt chuẩn Quốc gia mức 2.
Từ khi được công nhận chuẩn đến nay trường luôn giữ vững danh hiệu trường tiên tiến xuất sắc cấp thành phố được Bộ GD-ĐT và UBND thành phố tặng Bằng khen.
Năm học 1997-1998 trường được nhận cờ thi đua luân lưu của Thủ tướng Chính phủ
Năm học 2003-2004 trường được Thủ tướng Chính phủ tặng Bằng khen.
Năm học 2007-2008 trường vinh dự được Chủ tịch nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam tặng Huân chương lao động hạng Ba.
Nhờ biết giữ gìn, kế thừa và phát triển những thành quả do nhiều thế hệ thầy cô giáo và học sinh đã tạo nên với cả tấm lòng và tinh thần trách nhiệm nên qui mô và hoạt động của nhà trường liên tục phát triển.
Lễ cắt băng khánh thành Trường tiểu học Bế Văn Đàn
Toàn cảnh trường TH Bế Văn Đàn năm học 1995-1996
Thứ trưởng Lê Vũ Hùng về thăm trường
Vụ trưởng Nguyễn Kế Hào về thăm trường
Bộ GD&ĐT thẩm tra công nhận trường đạt chuẩn Quốc gia
Lãnh đạo Thành phố về thăm trường
Lãnh đạo Sở GD&ĐT về thăm trường
Đoàn đại biểu các tỉnh bạn về thăm trường
